Официальная история ИГЕМ РАН начинается с 1930 г. созданием на базе Геологического и Минералогического музея имени Петра Великого трех научно-исследовательских институтов:
- Минералогического,
- Геохимического,
- Петрографического (ПЕТРИН),
- Геологического (ГИН).
Далее в 1932 г. Геохимический и Минералогический институты были объединены в Институт геохимии, минералогии и кристаллографии им. М.В. Ломоносова (ЛИГЕМ). В 1937 г. ЛИГЕМ, ПЕТРИН и ГИН объединились в Институт Геологических наук (ИГН АН СССР), который в ноябре 1955 г. был разделен на два института - ИГЕМ и ГИН.